Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TCIRG1Q13488 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TCIRG1Q13488 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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