Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DUSP4Q13115 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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