Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SNX13Q9Y5W8 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SNX13Q9Y5W8 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SNX13Q9Y5W8 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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