Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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UHRF1Q96T88 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
UHRF1Q96T88 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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