Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RAB6CQ53S08 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms