Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLPPQ16740 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CLPPQ16740 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CLPPQ16740 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CLPPQ16740 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CLPPQ16740 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLPPQ16740 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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