Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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NEDD8Q15843 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NEDD8Q15843 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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