Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
TTF1Q15361 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
TTF1Q15361 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms