Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NECTIN1Q15223 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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