Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PCOLCEQ15113 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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