Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LAPTM4AQ15012 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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