Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TUBB3Q13509 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TUBB3Q13509 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms