Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTK7Q13308 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTK7Q13308 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTK7Q13308 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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PTK7Q13308 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTK7Q13308 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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PTK7Q13308 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTK7Q13308 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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