Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
TRAF3Q13114 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms