Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
NFIAQ12857 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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