Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KAT6B-203ENST00000372714 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
HOXD11P31277 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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