Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRAP18433 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRAP18433 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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