Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PSDA5PKW4 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PSDA5PKW4 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms