Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SH3BP4Q9P0V3 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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