Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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GEN1Q17RS7 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GEN1Q17RS7 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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