Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CCDC6Q16204 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCDC6Q16204 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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