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| CCDC6 | Q16204 | GMFB-208 | ENST00000554908 | 6721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CCDC6 | Q16204 | TRIQK-212 | ENST00000520686 | 1808 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.16 | □□□□□ -1.9 | | |
| CCDC6 | Q16204 | FPGT-TNNI3K-202 | ENST00000370895 | 7566 nt | TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CCDC6 | Q16204 | ZMYM1-210 | ENST00000611874 | 4466 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.9 | | |
| CCDC6 | Q16204 | NACAP2-201 | ENST00000318548 | 624 nt | BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | CHD9-218 | ENST00000566029 | 13110 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.15 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | PEX3-201 | ENST00000367591 | 1969 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | FTX-214 | ENST00000638437 | 12267 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.132-201 | ENST00000363421 | 102 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1078P-201 | ENST00000364522 | 103 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-359P-201 | ENST00000365466 | 108 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-1011P-201 | ENST00000384668 | 107 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RPL7P25-201 | ENST00000404151 | 721 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP000567.1-201 | ENST00000406413 | 156 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC008850.1-201 | ENST00000427546 | 362 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC119618.1-201 | ENST00000434191 | 222 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | AC108517.1-201 | ENST00000512546 | 327 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
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| CCDC6 | Q16204 | NDST1-AS1-201 | ENST00000519040 | 368 nt | TSL 2 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LINC02545-201 | ENST00000525381 | 306 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AF235103.2-201 | ENST00000525753 | 346 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | LINC02546-202 | ENST00000528119 | 801 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC090092.1-201 | ENST00000530576 | 510 nt | TSL 2 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC009320.1-201 | ENST00000549070 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR4319-201 | ENST00000577285 | 85 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP001021.1-201 | ENST00000577704 | 244 nt | TSL 3 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR3682-201 | ENST00000581338 | 84 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AP001029.3-201 | ENST00000588063 | 596 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC022335.1-204 | ENST00000590779 | 600 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC012119.1-201 | ENST00000603184 | 222 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC245014.2-201 | ENST00000603689 | 287 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC011468.4-201 | ENST00000603942 | 409 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC246785.4-201 | ENST00000605374 | 287 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC121334.2-201 | ENST00000605387 | 271 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | CEP164P1-207 | ENST00000608660 | 504 nt | TSL 5 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC012150.2-201 | ENST00000621300 | 544 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | YWHAEP7-203 | ENST00000622054 | 312 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | AC099506.2-201 | ENST00000623074 | 221 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MAPK10-266 | ENST00000641066 | 6555 nt | BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MUC7-202 | ENST00000413702 | 2540 nt | APPRIS P2 TSL 4 BASIC | 3.14 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | EIF2A-201 | ENST00000273435 | 2083 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Z82195.2-201 | ENST00000612348 | 18351 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-600P-201 | ENST00000362524 | 99 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | SNORA7.2-201 | ENST00000364446 | 145 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | RNU6-335P-201 | ENST00000364563 | 113 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | Y_RNA.573-201 | ENST00000384763 | 105 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |
| CCDC6 | Q16204 | MIR135A2-201 | ENST00000384854 | 100 nt | BASIC | 3.13 | □□□□□ -1.91 | | |