Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GRIK4Q16099 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms