Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
TAF1AQ15573 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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