Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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NKX1-1Q15270 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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NKX1-1Q15270 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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NKX1-1Q15270 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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NKX1-1Q15270 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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