Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NECTIN1Q15223 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms