Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFIXQ14938 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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