Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SSPNQ14714 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SSPNQ14714 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
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