Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
COL9A3Q14050 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COL9A3Q14050 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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