Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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NFIAQ12857 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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