Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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