Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
ATP9BO43861 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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