Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
TRAPPC9Q96Q05 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms