Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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