Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CARTPTQ16568 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CARTPTQ16568 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms