Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
NKX1-1Q15270 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NKX1-1Q15270 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms