Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
SHROOM2Q13796 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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SHROOM2Q13796 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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SHROOM2Q13796 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SHROOM2Q13796 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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