Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SRSF6Q13247 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms