Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
PRDM2Q13029 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PRDM2Q13029 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
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