Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
BNIP3Q12983 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BNIP3Q12983 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms