Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
TRIM35Q9UPQ4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
TRIM35Q9UPQ4 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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