Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
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GEN1Q17RS7 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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GEN1Q17RS7 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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GEN1Q17RS7 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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GEN1Q17RS7 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
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GEN1Q17RS7 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
GEN1Q17RS7 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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