Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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RTL8BQ17RB0 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
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RTL8BQ17RB0 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
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RTL8BQ17RB0 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RTL8BQ17RB0 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RTL8BQ17RB0 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
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