Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPROQ16827 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPROQ16827 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
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