Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF239Q16600 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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