Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GPNMBQ14956 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GPNMBQ14956 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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