Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SMCO1Q147U7 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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