Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
NEDD9Q14511 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms