Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A2Q14055 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
COL9A2Q14055 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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