Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CACNA1CQ13936 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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