Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RBBP4Q09028 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms